First isolation and molecular characterization of Cryptococcus neoformans var. grubii in excreta of birds in the urban perimeter of the Municipality of Popayán, Colombia.
Abstract Background Cryptococcosis is a systemic opportunistic mycosis, caused by Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii , which affects mainly the central nervous system of immunocompromised patients; no reports have been made on the isolation of the fungus from the environment of Popayán,...
| Publicado en: | Revista Iberoamericana de Micologia Vol. 35; no. 3; pp. 123 - 130 |
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| Autores principales: | , , , |
| Formato: | Artículo |
| Publicado: |
Elsevier B.V.
Jul2018
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| Sumario: | Abstract Background Cryptococcosis is a systemic opportunistic mycosis, caused by Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii , which affects mainly the central nervous system of immunocompromised patients; no reports have been made on the isolation of the fungus from the environment of Popayán, Colombia. Aims The main objective of this investigation was to determinate the incidence of C. neoformans in the urban perimeter in the City of Popayán, Colombia. Methods A total of 303 samples from droppings of Columba livia and Bubulcus ibis were collected between September 2012 and June 2013. The samples were processed by conventional techniques; identification of colonies was performed by biochemical tests, and molecular patterns were determined by PCR fingerprinting with the primer (GTG) 5 and restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the gene URA 5. Results A total of 118 (38.94%) samples were positive for Cryptococcus in excreta of C. livia , and 361 strains belonging to Cryptococcus neoformans var. grubii were isolated. From the latter, 99.2% corresponded to the molecular pattern VNI and 0.8% to VNII, with an increased occurrence (24.4%) at a temperature of 22.5 °C and a humidity of 60.8%. The excreta of B. ibis did not show the presence of the fungus. Conclusions C. livia excreta is a key environmental niche for C. neoformans var. grubii , type VNI, supporting growth and reproduction, and serving as a major source of infection for susceptible populations in Popayán. This represents the first report on the isolation of the agent of cryptococcosis from the environment in this region, with a significant prevalence in bird excreta. Resumen Antecedentes La criptococosis es una micosis sistémica oportunista provocada por Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gattii ; afecta principalmente al sistema nervioso central de pacientes inmunodeficientes. No existen publicaciones sobre el aislamiento del hongo en la región de Popayán, Colombia. Objetivos El objetivo principal de este estudio fue establecer la incidencia de C. neoformans en el perímetro urbano de la ciudad de Popayán, Colombia. Métodos Se recogió un total de 303 muestras de materia fecal de las aves Columba livia y Bubulcus ibis entre septiembre de 2012 y junio de 2013. Las muestras se procesaron con técnicas convencionales de cultivo; la identificación de las colonias se realizó mediante pruebas bioquímicas, y los patrones moleculares se establecieron mediante PCR con el cebador (GTG) 5 y la técnica de polimorfismos de longitud de los fragmentos de restricción (RFLP, por su abreviatura en inglés) del gen URA 5. Resultados Un total de 118 (38,94%) muestras de excrementos de C. livia fueron positivas para Cryptococcus y se recuperaron 361 aislamientos pertenecientes a Cryptococcus neoformans var. grubii , de los cuales el 99,2% correspondían al patrón molecular VNI y el 0,8% al VNII, con un aumento en la incidencia (24,4%) a una temperatura de 22,5 °C y una humedad del 60,8%. No hubo crecimiento de este hongo en los excrementos de B. ibis. Conclusiones Los excrementos de C. livia son un nicho ambiental fundamental para C. neoformans var. grubii , tipo VNI; ello permite su crecimiento y reproducción, y que sean una potencial fuente de infección para la población susceptible de Popayán. Esta es la primera publicación sobre el aislamiento del agente etiológico de la criptococosis en el entorno de esta región, con una prevalencia considerable en los excrementos de aves. |
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