A Population Study: HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQB1, -DQA1 Alleles, and ABDR Haplotype Frequencies in the Aegean Region of Türkiye.
Objective: Human leukocyte anti-gen (HLA) molecules are vital molecules because they present foreign anti-gens to immune cells and trigger the immune response. Thus, they are associated with diseases, and they play crucial roles in solid organ transplantation and hematopoietic stem cell transplantat...
| Publicado en: | Forbes Journal of Medicine Vol. 6; no. 1; pp. 1 - 9 |
|---|---|
| Autores principales: | , , , , , , |
| Formato: | research tables/charts Journal Article |
| Publicado: |
Galenos Yayinevi Tic. LTD. STI
2025
|
| Acceso en línea: | Ver este registro en EBSCOhost |
| fields | @attributes: recordID: 1 pdfLink: plink: https://search.ebscohost.com/login.aspx?direct=true&db=ccm&AN=184493403&site=ehost-live header: @attributes: shortDbName: ccm uiTerm: 184493403 longDbName: CINAHL Complete uiTag: AN controlInfo: bkinfo: dissinfo: jinfo: jid: 27179443 MPM9 jtl: Forbes Journal of Medicine issn: 27179443 maglogo: N pubinfo: dt: 2025 vid: 6 iid: 1 pid: 28155 pub: Galenos Yayinevi Tic. LTD. STI artinfo: ui: 184493403 184493403 184493403 10.4274/forbes.galenos.2024.50375 184493403 ppf: 1 ppct: 8 formats: fmt: @attributes: type: P tig: atl: A Population Study: HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQB1, -DQA1 Alleles, and ABDR Haplotype Frequencies in the Aegean Region of Türkiye. aug: au: KOÇYİĞİT, Aslı ÖZKIZILCIK AYNA, Tülay KILIÇASLAN SOYÖZ, Mustafa ALKAÇ, Burcu ÇERÇİ GÜLEÇ, Rasime Derya TOPÇU, Deniz İlhan PİRİM, İbrahim affil: İzmir Katip Çelebi University Faculty of Medicine, Department of Medical Biology, İzmir, Türkiye sug: subj: HLA Antigens Histocompatibility Antigens Alleles Haplotypes Immunogenetics Population Health Turkiye Human Turkiye Polymorphism, Genetic Bone Marrow Living Donors Oligonucleotide Array Sequence Analysis Drug Discovery Organ Transplantation ab: Objective: Human leukocyte anti-gen (HLA) molecules are vital molecules because they present foreign anti-gens to immune cells and trigger the immune response. Thus, they are associated with diseases, and they play crucial roles in solid organ transplantation and hematopoietic stem cell transplantation. This study aimed to determine the HLA allele and three-locus haplotype frequencies of the Turkish population. This is the first study in Türkiye to include such a large, sizable population. Methods: The study included 6,039 bone marrow donors. Sequence-specific oligonucleotide probes and sequence-specific primers were employed for HLA typing. After excluding related individuals, 1222 A, 1229 B, 930 DRB1, 102 C, 227 DQB1, 163 DQA1 allele couples, and 336 ABDR haplotype couples were analyzed using Arlequin v3.5 Software and the R package programs. The results were compared with those from the border countries. Results: The most frequently observed HLA alleles were A*02, B*35, C*07, DRB1*11, DQA1*01, and DQB1*03. The most prevalent ABDRB1 haplotype was A*24 B*35 DRB1*11 in our population. For all loci, the population was in Hardy-Weinberg equilibrium. A linkage disequilibrium analysis revealed a strong link between the A-B, A-DRB1, and B-DRB1 loci. The results of the two methods were similar. Conclusion: These findings are consistent with populations in bordering nations. Our findings will support numerous therapeutic applications, including drug discovery, disease therapy, and organ transplantation. The Arlequin and R programs are suitable for analyses. Amaç: İnsan lökosit antijeni (HLA) molekülleri yabancı antijenleri immün hücrelere sundukları ve immün yanıtı başlatmaları açısından önemli moleküllerdir. Bu sebeple, hastalıklarla ilişkili oldukları gibi solid organ ve hematopoetik hücre nakillerinde kritik rol oynarlar. Bu çalışmada, Türk popülasyonundaki HLA allel ve 3 lokus haplotip frekanslarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu çalışma Türkiye'de yapılmış en büyük popülasyonu içermektedir. Yöntem: Bu çalışmaya 6.039 kemik iliği vericisi dahil edilmiştir. HLA tiplemesi sekans spesifik oligonükleotit prob ve sekans spesifik primer yöntemleriyle gerçekleştirilmiştir. Akraba kişiler hariç tutulduktan sonra toplamda 1222 A, 1229 B, 930 DRB1, 102 C, 227 DQB1 ve 163 DQA1 allel çiftiyle birlikte 336 ABDR haplotip çifti Arlequin v3.5 Programı ve R paket program ile analiz edilmiştir. Sonuçlar komşu ülkelerdeki frekanslarla karşılaştırılmıştır. Bulgular: Popülasyonumuzda en sık saptanan HLA alleleri A*02, B*35, C*07, DRB1*11, DQA1*01 ve DQB1*03 olarak bulundu. En sık prevalansa sahip ABDRB1 haplotipi ise A*24 B*35 DRB1*11 olarak belirlendi. Bütün lokuslar için popülasyonumuz Hardy-Weinberg eşitliğine uymaktaydı. Bağlantı eşitsizliği analizine göre A-B, A-DRB1 ve B-DRB1 lokusları arasında güçlü bir bağlantı olduğunu gösterdi. Her iki istatistiksel analiz sonucu da aynı çıktı. Sonuç: Bulgular komşu ülkelerle benzer oranda çıkmıştır. Bu bulgular ilaç keşfi, hastalık tedavisi ve organ nakli gibi birçok terapötik uygulamayı destekleyici niteliktedir. Bu istatistiksel analizler için Arlequin ve R programlarının uygun olduğu görülmüştür. pubtype: Academic Journal doctype: research tables/charts Journal Article ougenre: Article language: English refInfo: holdings: @attributes: islocal: N |
|---|