Identification of fungal clinical isolates by matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry.
Background. Recently, bacterial identification by MAL-DI-TOF MS has acquired a high relevance in terms of speed and reliability. Conventional mycological identification has some disadvantages: it is frequently slow, reliability is sometimes low, and an extensive experience is required. The risk popu...
| Publicado en: | Revista Española de Quimioterapia Vol. 26; no. 3; pp. 193 - 198 |
|---|---|
| Autores principales: | , , , , , , , |
| Formato: | Artículo |
| Publicado: |
Sociedad Espanola de Quimioterapia
sep2013
|
| Materias: | |
| Acceso en línea: | Ver este registro en EBSCOhost |
| Sumario: | Background. Recently, bacterial identification by MAL-DI-TOF MS has acquired a high relevance in terms of speed and reliability. Conventional mycological identification has some disadvantages: it is frequently slow, reliability is sometimes low, and an extensive experience is required. The risk popula¬tion for fungal infections, and therefore their clinical signifi¬cance has progressively increased in recent years. Methods. 153 yeast and mould clinical isolates were ana¬lyzed by MALDI-TOF MS and conventional identification. When both methods were discrepant to the genus or species level, ITS-2 sequencing was performed. Results. The correlation in yeasts identification between conventional identification methods and MALDI-TOF MS was extremely high (99.2% to the species level and 100% to the genus level). The only discrepancy was checked by ITS-2 se¬quencing and confirmed the MALDI-TOF identification. The correlation in moulds identification was more heterogeneous. 68.7% of the isolates showed correlation at least to the genus level and 40.6% to the species level. Therefore, the correlation between conventional identification and MALDI-TOF MS in fungal identification was, in whole, 87% to the species level, and 93.5% to the genus level. Conclusions. Identification of fungi by MALDI-TOF MS is reliable and shows potential advantages over conventional identification methods. Introducción. En los últimos años, la identificación bac¬teriana mediante espectrometría de masas (EM) MALDI-TOF ha adquirido progresivamente importancia, dada su rapidez y fiabilidad. La identificación micológica convencional tiene algunos inconvenientes, como son su lentitud, su baja fiabilidad en algunos casos, y el hecho de que para algunos pro¬cedimientos es imprescindible la intervención de personas con amplia experiencia. Sin embargo, la población de riesgo para infecciones fúngicas, y por tanto su importancia clínica, han aumentado en los últimos años. Material y métodos. Se identificaron 153 aislamientos de hongos filamentosos y de levaduras mediante métodos convencionales y mediante EM MALDI-TOF. Cuando se dieron discrepancias entre ambos, éstas fueron dilucidadas mediante secuenciación del segmento ITS-2. Resultados. La correlación entre los métodos convencio¬nales y la EM MALDITOF para la identificación de levaduras fue muy alta (99,2% a nivel de especie y 100% al de géne¬ro). La única discrepancia que debió ser comprobada mediante secuenciación, corroboró el resultado obtenido con la EM. La correlación fue más heterogénea en el caso de los hongos fila¬mentosos. 68,7% de los aislamientos mostraron correlación al menos al nivel de género, y 40,6% al nivel de especie. En con¬junto, la correlación entre identificación convencional y MAL¬DI-TOF para la identificación de hongos fue del 87% al nivel de especie, y del 93,5% a nivel de género. Conclusiones. La identificación de hongos mediante EM MALDI-TOF es fiable, y presenta ventajas potenciales con re¬specto a los métodos convencionales. |
|---|